Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAM2Q15035 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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