Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms