Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms