Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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