Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP1Q13835 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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