Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms