Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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MKRN4PQ13434 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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MKRN4PQ13434 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKRN4PQ13434 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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