Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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