Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD2Q13200 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms