Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAF1AQ13111 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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