Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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