Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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