Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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