Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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