Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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EFEMP1Q12805 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFEMP1Q12805 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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