Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms