Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms