Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL16A1Q07092 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms