Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK18Q07002 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms