Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD164Q04900 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD164Q04900 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms