Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms