Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms