Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN1Q04323 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms