Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TOP2BQ02880 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOP2BQ02880 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms