Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL6Q02878 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms