Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms