Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEX3Q00994 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms