Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDK3Q00526 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDK3Q00526 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDK3Q00526 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDK3Q00526 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK3Q00526 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms