Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms