Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms