Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2IP78347 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IP78347 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms