Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITX1P78337 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITX1P78337 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX1P78337 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX1P78337 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms