Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms