Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTA1P68133 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms