Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VBP1P61758 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms