Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP25P60880 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms