Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms