Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms