Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms