Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB27AP51159 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB27AP51159 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB27AP51159 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB27AP51159 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms