Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF6P49848 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF6P49848 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms