Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRPC1P48995 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRPC1P48995 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms