Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms