Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT6CP48668 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT6CP48668 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms