Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLMP48507 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLMP48507 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLMP48507 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLMP48507 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLMP48507 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLMP48507 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLMP48507 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms