Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A9P48067 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms