Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IQGAP1P46940 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IQGAP1P46940 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IQGAP1P46940 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IQGAP1P46940 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms