Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCCP43146 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCCP43146 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCCP43146 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCCP43146 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DCCP43146 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCCP43146 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCCP43146 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms