Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms