Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPOP42166 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPOP42166 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms